База данных Protein FAMilies

Описание доменной структуры белка SYK1_ECOLI

Белок SYK1_ECOLI имеет два домена:

Первый домен: идентификатор Pfam - PF01336 сокращенное название - tRNA anti полное название - Семейство Домен ОВ-складчатости при связи нуклеидных кислот положение домена в последовательности - 67-145 Второй домен: идентификатор Pfam - PF00152 сокращенное название - tRNA-synt 2 полное название - тРНК синтетаза II (аспарагиновая к-та, лизин, аспарагин) положение домена в последовательности - 161-502

идентификатор PDB 1bbu

Это семейство содержит домены, связывающие нуклеиновые кислоты. Это семейство включает антикодонсвязывающий домены лизил-, аспартил- и аспарагинил-тРНК синтетаз. Аминоацил-тРНК синтетазы катализируют присоединение амнокислоты к соответствующей молекуле тРНК. Это семейство также включает часть RecG геликазы, вовлечённой в восстановление ДНК. Репликационый фактор А является гетеротример комплексом, который содержит субединицу в этом семействе. Этот домен также найден в C-конце альфа-цепи полимеразы III бактериологической ДНК.

Всего известно белков с доменам tRNA anti 1618 Домен tRNA anti встречается в белках в сочетании с другими доменами реже, чем один (782 белка с одним доменом Acr_tran). Известен случай дупликации домена tRNA anti - Q9GYL8_CAEEL Cлучаи перестановки 2-х доменов местами, если один из доменов -tRNA anti , неизвестны.

Надцарство Таксон Количество белков с доменом PF00873(Acr_tran) Эукариоты 206 Растения 47 Грибы 77 Животные 102 Бактерии Все 901 Археи Все 131